Dresden
Technology Portal

 
Your access to research infrastructure and know-how
de|en
View all services of this unit

Next Generation Sequencing (NGS) - Paneldiagnostik und Exom-Sequenzierung

Basic Information

Name: Next Generation Sequencing (NGS) - Paneldiagnostik und Exom-Sequenzierung
Facility: Genetic Diagnostics (GD)
Partner: Technische Universität Dresden (TUD)
Partner: University Hospital Carl Gustav Carus Dresden (UKD)

Short Description

Wir bieten die hochdurchsatzbasierte Sequenzierung von 94 Genen an, die mit einer erhöhten Tumorprädisposition einhergehen. Zudem führen wir die Sequenzierung von ca. 4800 Genen durch, die...

Description

Um auch größere Gengruppen (sogenannte „Gen-Panels“) schnell, gründlich und kostengünstig auf Sequenzebene untersuchen zu können, haben wir die Hochdurchsatzsequenzierung (engl. „Next Generation Sequencing“, NGS) etabliert. Der Begriff "nächste Generation" distanziert dieses Verfahren von der Sequenzierung der ersten Generation, bei der jeder einzelne Lesevorgang ("Read") in einem separaten Reaktionsgefäß stattfindet, hohe Volumina an Reagenzien erforderlich sind und die Sequenziergeschwindigkeit aufgrund der elektrophoretischen Fragment-Auftrennung gering ist. Im Gegensatz hierzu wird beim Sequenzierverfahren der zweiten Generation extrem parallelisiert, extrem miniaturisiert und extrem schnell sequenziert. So erzeugt das von uns verwendete Sequenziergerät "MiSeq" bis zu 1 Million Reads pro Quadratmillimeter Reaktionsoberfläche (⇒Miniaturisierung). Insgesamt werden pro Lauf bis zu 25 Millionen Reads gleichzeitig erzeugt (⇒Parallelisierung) und ein Lauf benötigt je nach Read-Länge etwa 10 Stunden, also etwa 700 Reads pro Sekunde (⇒Geschwindigkeit).

An unserem Institut bieten wir die hochdurchsatzbasierte Sequenzierung von 94 Genen an, die mit einer erhöhten Tumorprädisposition einhergehen. Des Weiteren führen wir die Sequenzierung von ca. 4800 Genen durch, die mit genetisch bedingten Erkrankungen assoziiert sind.

Link to Further Details

https://tu-dresden.de/med/mf/kge/diagnostik-einsender/methodenspektrum#section-1

Points of Contact

Frau Dr. rer. medic. Sandra Oster
Email:
Phone:
+49 (0)351 458-5138
Fax:
+49 (0)351 458-6337

Access Requirements

Hier finden Sie das Informationsblatt zur Aufklärung vor genetischen Analysen gemäß Gendiagnostikgesetz (GenDG).

Last Update

Last updated at: 5 November 2018 at 10:37:28